夫妻离婚后子女的抚养问题的处理办法：一般来说，应该由夫妻双方协议处理。协议不成的，不满两周岁的子女，以由母亲直接抚养为原则。已满两周岁的子女，父母由人民法院根据双方的具体情况，按照最有利于未成年子女的原则判决。子女已满八周岁的，应当尊重其真实意愿。
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起诉离婚，并要求对方承担抚养费
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针对您提出的案件，从法律的角度为您作如下解答：1.提供证据证明夫妻不在一起居住即可认定分居。2.婚姻存续期间不存在孩子抚养费纠纷，您可以在离婚后主张孩子抚养费。3.分居两年不会直接认定离婚，需要办理离婚登记或者起诉离婚