擅自离职公司可依法处罚。依据《劳动合同法》，单位可按规章制度警告、罚款；若造成重大损害，可辞退。不及时处理可能导致管理混乱、损失扩大。
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擅自离职需处理。具体操作：1. 轻微违规，依据公司规章给予警告或罚款；2. 严重违规，如造成重大损害，立即辞退并追责；3. 涉及违法，如盗窃公司财物，报警处理。
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处理擅自离职常见方式有警告、罚款、辞退。选择时需考虑员工行为性质及后果，轻微违规可警告罚款，严重损害则辞退。