公司应支付法定医疗期内工资，之后若解雇需支付补偿金。依据《劳动合同法》，医疗期内公司需支付工资，且不得低于最低工资80%。医疗期后若无法继续工作，公司可解雇但需支付经济补偿，否则将违反法律规定，可能面临法律诉讼和赔偿。
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公司应按规定处理。1.医疗期内：继续支付员工工资，最低不得低于当地最低工资标准的80%，确保员工基本生活。2.医疗期后：若员工不能从事原工作，公司可提前30日通知或支付代通知金后解雇，同时需按法律规定支付经济补偿金，以保障员工权益。
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处理方式有继续支付工资或依法解雇并补偿。选择时应考虑员工医疗期是否结束及能否胜任原工作。若医疗期内，公司应继续支付工资；医疗期后不能胜任，则可依法解雇并支付经济补偿金。